Jean-Paul Linnartz is als Research Fellow verbonden aan Philips Research in Eindhoven. Eerder leidde hij als Senior Director de research groep Electronic Systems and Silicon Integration, en was hij afdelingshoofd van research groepen werkzaam op het gebied van wireless LANs, digitale televisie, en andere vormen draadloze communicatie en op het gebied van informatie security, cryptografie, elektronische watermerken en copy protectie.

Hij studeerde in 1986 met lof af aan de Technische Universiteit Eindhoven. Hij promoveerde in 1991 met lof aan de Technische Universiteit Delft op de prestatie- en verkeersanalyse van de mobile communicatienetwerken. Voor dit werk kreeg hij de NERG Veder Prijs.

In 1992 en 1993, doceerde hij als Assistant Professor aan The University of California at Berkeley. Hier deed hij onderzoek aan draadloze multimedia communicatie. In 1993, publiceerde hij de eerste publicatie over Multi-Carrier CDMA. In 1994 werd hij Universitair Hoofddocent aan de T.U. Delft.

Toen hij in 1995 in dienst trad van Philips Research ging hij bij het Nat.Lab. werken aan content protectie, digitale watermarken en conditional access. Hij ontwikkelde en patenteerde methoden om watermerken betrouwbaarder te detecteren, die nu worden toegepast in diverse systemen. Hij ontdekte en publiceerde niewe aanvalsmethoden op watermerk systemen en hij ontwikkelde tegenmaatregelen. Ten behoeve van biometrische herkenning ontwikkelde hij methoden om de privacy van biometrische gegevens te beschermen. 

Sinds 2006 is hij ook Deeltijd Hoogleraar aan de Technische Universiteit Eindhoven.

Jean-Paul Linnartz schreef meer dan 100 wetenschappelijke publicaties, en hij is (mede-) auteur van vier boeken. Hij ontwikkelde de wetenschappelijk-educatieve CD-ROM "Wireless Communication". Hij heeft 30 patenten.

In de periode 1980 -1985 maakte hij radioprogrammas voor diverse lokale en regionale radiostations in Nederland en Belgie. Van 1999 tot 2001 had een Tech-Talk Internet radiostation..